RESUMO A frequência de estudos moleculares visando a analisar os promotores de metilação de genes supressores de tumor e proteômica globais na carcinogênese gástrica está aumentando. No entanto, apenas alguns consideraram os diferentes tipos de células do estômago, a localização do tumor e a influência da infecção por Helicobacter pylori e pelo vírus Epstein-Barr (EBV). Diferenças moleculares relacionadas com áreas tumorais anatômicas e histológicas também foram recentemente descritas. Os autores propõem uma classificação molecular de câncer gástrico, dividindo-o em quatro subtipos: tumores positivos para o EBV; tumores microssatélite instáveis; tumores genomicamente estáveis e tumores com instabilidade cromossômica.

ABSTRACT The frequency of molecular studies aimed to analyze promoter methylation of tumor suppressor genes and global proteomics in gastric carcinogenesis is increasing. Nonetheless, only a few considered the different types of stomach cells, the tumor location and the influence of Helicobacter pylori and Epstein Barr virus infection (EBV). Molecular differences relating to anatomical and histological tumor areas were also recently described. The authors propose a molecular classification of gastric cancer, dividing it into four subtypes: tumors positive for EBV; microsatellite unstable tumors; genomically stable tumors and tumors with chromosomal instability.

BACKGROUND: DNA methylation is commonly linked with the silencing of the gene expression for many tumor suppressor genes. As such, determining DNA methylation patterns should aid, in times to come, in the diagnosis and personal treatment for various types of cancers. Here, we analyzed the methylation pattern from five colorectal cancer patients from the Amazon state in Brazil for four tumor suppressor genes, viz.: DAPK, CDH1, CDKN2A, and TIMP2 by employing a polymerase chain reaction (PCR) specific to methylation. Efforts in the study of colorectal cancer are fundamental as it is the third most of highest incidence in the world. RESULTS: Tumor biopsies were methylated in 1/5 (20 %), 2/5 (40 %), 4/5 (80 %), and 4/5 (80 %) for CDH1, CDKN2A, DAPK, and TIMP2 genes, respectively. The margin biopsies were methylated in 3/7 (43 %), 2/7 (28 %), 7/7 (100 %), and 6/7 (86 %) for CDH1, CDKN2A, DAPK, and TIMP2, respectively. CONCLUSIONS: Our findings showed DAPK and TIMP2 to be methylated in most samples from both tumor tissues and adjacent non-neoplastic margins; thus presenting distinct methylation patterns. This emphasizes the importance of better understanding of the relation of these patterns with cancer in the context of different populations.

Esta revisão abrange as principais técnicas, limitações e utilidades da espectrometria de massa aplicada à análise de fluidos biológicos para buscar biomarcadores com potencialidade de diagnóstico médico. Atualmente esse método é capaz de discernir, em segundos, padrões moleculares diferencialmente expressos entre indivíduos controles e com câncer. Resultados da literatura apontam a espectrometria de massa como metodologia promissora no futuro do diagnóstico.

This manuscript reviews mass spectrometry methods and limitations for analisys of biological fluids in the search for biomarkers that can aid medical diagnosis. Currently, mass spectrometry has the ability to discriminate differentially expressed molecular patterns among cancer patients and control subjects. Results in the literature point mass spectrometry as having a major role in the future of medical diagnosis.

OBJETIVO: Estudar a ação do álcool perílico na expressão gênica de células de adenocarcinoma de pulmão humano. MÉTODOS: Incubaram-se células de adenocarcinoma de pulmão com álcool perílico em diluições que variaram entre 0,03% e 0,0003% por 48 horas. Observaram-se as alterações na morfologia celular e quantificou-se a viabilidade celular pelo método do MTT (3-(4,5-dimetiltiazol-2-yl)-2,5 difeniltertrazolim brometo). Analisou-se a síntese de proteínas das amostras previamente marcadas radioativamente com 35S, através de eletroforese em gel de poliacrilamida. Determinou-se a expressão das proteínas p53 e p42/44 através do método de Western Blot. RESULTADOS: Após 48 horas de incubação, observaram-se alterações na morfologia celular para a diluição de 0,03% de álcool perílico, as quais foram pouco verificadas em diluições superiores a 0,003%. A inibição da viabilidade celular foi de 60,17% (p < 0,001), 15,62% (p < 0,001) e 11,53% (p < 0,05) para as diluições de 0,03%, 0,003% e 0,0003% de álcool perílico, respectivamente. Os resultados mostram a indução de proteínas de 110 kDa, 42 kDa e 28 kDa. Não se observou variação estatisticamente significativa para a expressão da proteína p53. Em comparação com a expressão de alfa-tubulina, a diluição de 0,003% de álcool perílico provocou uma diminuição marcante da fosforilação da p44 e um aumento da fosforilação da p42. CONCLUSÃO: Os resultados apresentados sugerem novos caminhos metabólicos da ação do álcool perílico em células de adenocarcinoma de pulmão humano.

OBJECTIVE: To study the effect of perillyl alcohol on the gene expression of human pulmonary adenocarcinoma cells. METHODS: Pulmonary adenocarcinoma cells were incubated with perillyl alcohol in dilutions ranging from 0.03% to 0.0003% for 48 hours. Alterations were observed in the cell morphology, and cell viability was quantified using [3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide] assays. Protein synthesis of samples previously targeted with S35 was analyzed using electrophoresis on a polyacrylamide gel. Expression of the proteins p53 and p44/42 was determined using the Western blot method. RESULTS: After 48 hours of incubation, greater nsumbers of morphological alterations were observed in cells treated with the 0.03% perillyl alcohol dilution than in those treated with perillyl alcohol diluted to 0.003% or further. Treatment with perillyl alcohol dilutions of 0.03%, 0.003% and 0.0003% inhibited cellular viability by 60.17% (p < 0.001), 15.62% (p < 0.001) and 11.53% (p < 0.05), respectively. The results show that 28-kDa, 42-kDa and 110-kDa proteins were induced. No statistically significant effect on p53 expression was observed. In comparison with the expression of alpha-tubulin, the 0.003% perillyl alcohol dilution induced an increase in p42 phosphorylation and a marked decrease in p44 phosphorylation. CONCLUSION: The results suggest that there are other, previously undescribed, metabolic pathways for perillyl alcohol effects in human pulmonary adenocarcinoma cells.

MOTIVAÇÃO: Neste trabalho foi analisado o perfil de proteínas séricas de pacientes com doença de Hodgkin (DH) localizada e avançada em busca de novos e potenciais biomarcadores para o diagnóstico médico. MATERIAIS E MÉTODOS: O perfil de proteínas presentes no soro de 14 indivíduos saudáveis, 14 pacientes com DH avançada e 15 pacientes com DH localizada, assim como pools de soro dos respectivos grupos, foi analisado em gel desnaturante de poliacrilamida a 12% corado pela prata. A densitometria e a intensidade média das bandas de interesse foram estudadas utilizando-se o Kodak 1D Scientific Imaging System. RESULTADOS E CONCLUSÕES: O perfil protéico apresentou acentuada variação entre os pacientes examinados; entretanto foi observada a indução predominante de determinadas proteínas (aproximadamente 26kDa e 18kDa), cuja expressão foi substancialmente diferente quando em comparação com os controles (p < 0,01). Estas proteínas podem potencialmente constituir-se em marcadores moleculares de acompanhamento da evolução e do tratamento da doença.

AIM: In this work the serum protein profile of patients with localized and advanced Hodgkin's disease (HD) was analyzed to search for new potential biomarkers of medical interest. MATERIALS AND METHODS: The serum protein profile of 14 healthy donors, 14 patients with advanced disease, 15 patients with localized disease and serum pools of the respective groups, were analyzed using silver stained 12% denaturating polyacrylamide gel. The densitometry and mean band intensity from the bands of interest were analyzed using the Kodak 1D Scientific Imaging System. RESULTS AND CONCLUSION: The patients' protein profiles presented heterogenous variations; however over-expressed proteins of approximately 26kDa and 18kDa were proven to be statistically different when compared to healthy donors. Such proteins could potentially constitute in molecular markers for diagnosis and patient treatment follow-up.